研究與開發(fā)
干貨分享丨代謝組學(xué)問題集錦之送檢篇
在進(jìn)階篇中我們了解到代謝組學(xué)主要的檢測(cè)方法和檢測(cè)平臺(tái)。那么要做代謝組學(xué)檢測(cè),應(yīng)該如何準(zhǔn)備樣本?需要的樣本類型是怎樣的?今天在本篇文章中會(huì)有相關(guān)解答,學(xué)完你就不再是代謝祖學(xué)小白!
1
代謝組學(xué)要求組內(nèi)生物重復(fù)數(shù)(N)是多少?
答
動(dòng)物實(shí)驗(yàn)每組不少于10個(gè),臨床樣本每組不少于30個(gè)。生物重復(fù)數(shù)的不足,不構(gòu)成檢測(cè)的技術(shù)障礙,主要是會(huì)影響后續(xù)數(shù)據(jù)分析的可靠性,一定數(shù)量的樣本才能代表總體。
2
是送檢血清還是血漿?
答
對(duì)于NMR檢測(cè)來說,使用EDTA抗凝血漿是不合適的,會(huì)產(chǎn)生較大的信號(hào)干擾,盡量選擇肝素抗凝。
對(duì)于色譜質(zhì)譜檢測(cè)來說,血清、血漿并沒有特別的要求,但是需要互相比較的樣本類型要一致。
3
血樣發(fā)生溶血是否對(duì)檢測(cè)有影響?
答
對(duì)NMR檢測(cè)是有影響的,后續(xù)要進(jìn)行PCA分析看是否異常,異常則要剔除該樣本的數(shù)據(jù)。
對(duì)色譜質(zhì)譜檢測(cè)來說,暫未發(fā)現(xiàn)顯著影響。
4
代謝組學(xué)樣本要如何收集?
答
通常來說,需要使用液氮猝滅,再轉(zhuǎn)移到-80度冰箱長(zhǎng)期保存。但是血樣、組織、細(xì)胞樣品的收集過程各不相同,可以聯(lián)系我們索取建議方法。
5
樣本寄送必須要使用干冰嗎?
答
是的,代謝需要酶的參與,酶發(fā)生作用需要液體水的存在,液氮猝滅可以使水變成玻璃態(tài),從而讓酶沒有用武之地。不使用-80度冰箱或干冰,會(huì)有化凍的風(fēng)險(xiǎn),酶又會(huì)開始工作。
6
樣本可以分成多批檢測(cè)嗎?
答
靶向定量檢測(cè),特別是有加入內(nèi)標(biāo)的項(xiàng)目,對(duì)于不同批次是完全一致的;相對(duì)定量檢測(cè),比如非靶分析,儀器在不同時(shí)間(樣品批次)的響應(yīng)不盡相同,會(huì)導(dǎo)致不同批數(shù)據(jù)不可比。
7
檢測(cè)多個(gè)項(xiàng)目要準(zhǔn)備多份樣本嗎?
答
是的,特別是靶向定量檢測(cè),每個(gè)項(xiàng)目都會(huì)消耗一定量的樣本,在給客戶明確檢測(cè)方案后,我們推薦每管樣本比總量要略多一些,我們收到后會(huì)統(tǒng)一分裝,保證樣品解凍時(shí)間盡可能短,凍融次數(shù)一致。
8
除了樣本,還需要寄送標(biāo)準(zhǔn)品嗎?
答
我們能提供的檢測(cè)項(xiàng)目,公司均具備相應(yīng)的標(biāo)準(zhǔn)品,不需要客戶額外提供。
9
代謝組學(xué)常用的分析有哪些?
答
在拿到檢測(cè)結(jié)果后,往往還需要進(jìn)行單變量分析、多變量分析、代謝通路、火山圖、熱圖等后續(xù)分析。均有成熟的軟件或在線工具處理,我公司可免費(fèi)提供相關(guān)教程。
10
檢測(cè)報(bào)告包括哪些內(nèi)容?
答
包括代謝物的定量/相對(duì)定量數(shù)據(jù)、實(shí)驗(yàn)設(shè)備、實(shí)驗(yàn)方法等信息,我公司提供完善的售后服務(wù),助力用戶的成果發(fā)表。