要做代謝組學(xué)檢測,應(yīng)該如何準備樣本?需要的樣本類型是怎樣的?今天在本篇文章中會有相關(guān)解答,學(xué)完你就不再是代謝祖學(xué)小白!
1)代謝組學(xué)要求組內(nèi)生物重復(fù)數(shù)(N)是多少?
答:動物實驗每組不少于10個,臨床樣本每組不少于30個。生物重復(fù)數(shù)的不足,不構(gòu)成檢測的技術(shù)障礙,主要是會影響后續(xù)數(shù)據(jù)分析的可靠性,一定數(shù)量的樣本才能代表總體。
2)是送檢血清還是血漿?
答:對于NMR檢測來說,使用EDTA抗凝血漿是不合適的,會產(chǎn)生較大的信號干擾,盡量選擇肝素抗凝。
對于色譜質(zhì)譜檢測來說,血清、血漿并沒有特別的要求,但是需要互相比較的樣本類型要一致。
3)血樣發(fā)生溶血是否對檢測有影響?
答:對NMR檢測是有影響的,后續(xù)要進行PCA分析看是否異常,異常則要剔除該樣本的數(shù)據(jù)。
對色譜質(zhì)譜檢測來說,暫未發(fā)現(xiàn)顯著影響。
4)代謝組學(xué)樣本要如何收集?
答:通常來說,需要使用液氮猝滅,再轉(zhuǎn)移到-80度冰箱長期保存。但是血樣、組織、細胞樣品的收集過程各不相同,可以聯(lián)系我們索取建議方法。
5)樣本寄送必須要使用干冰嗎?
答:是的,代謝需要酶的參與,酶發(fā)生作用需要液體水的存在,液氮猝滅可以使水變成玻璃態(tài),從而讓酶沒有用武之地。不使用-80度冰箱或干冰,會有化凍的風(fēng)險,酶又會開始工作。
6)樣本可以分成多批檢測嗎?
答:靶向定量檢測,特別是有加入內(nèi)標的項目,對于不同批次是完全一致的;相對定量檢測,比如非靶分析,儀器在不同時間(樣品批次)的響應(yīng)不盡相同,會導(dǎo)致不同批數(shù)據(jù)不可比。
7)檢測多個項目要準備多份樣本嗎?
答:是的,特別是靶向定量檢測,每個項目都會消耗一定量的樣本,在給客戶明確檢測方案后,我們推薦每管樣本比總量要略多一些,我們收到后會統(tǒng)一分裝,保證樣品解凍時間盡可能短,凍融次數(shù)一致。
8)除了樣本,還需要寄送標準品嗎?
答:我們能提供的檢測項目,公司均具備相應(yīng)的標準品,不需要客戶額外提供。
9)代謝組學(xué)常用的分析有哪些?
答:在拿到檢測結(jié)果后,往往還需要進行單變量分析、多變量分析、代謝通路、火山圖、熱圖等后續(xù)分析。均有成熟的軟件或在線工具處理,我公司可免費提供相關(guān)教程。
10)檢測報告包括哪些內(nèi)容?
答:包括代謝物的定量/相對定量數(shù)據(jù)、實驗設(shè)備、實驗方法等信息,我公司提供完善的售后服務(wù),助力用戶的成果發(fā)表。